Szkoła wybudowana została przez osadników niemieckich ok. 1910r. jako własność parafii ewangielicko-augsburskiej. Po I wojnie światowej szkoła była polska. Uczęszczało do niej również kilkoro dzieci narodowości niemieckiej. Pierwszym kierownikiem szkoły był p. Ludwik Boczoń.

Jednym z kolejnych kierowników był p. Wojciech Dydo. Do wybuchu wojny pracowało 9 nauczycieli łącznie z kierownikiem. Była to szkoła 7-klasowa.
Podczas wojny szkołę zamieniono na niemieckie koszary. Kierownika wywieziono do Generalnej Gubernii, gdzie zmarł. Później była to szkoła dla dzieci niemieckich, a następnie warsztaty stolarskie i telefoniczne magazyny. Podczas wyzwolenia: zniszczono część dachu, wybito szyby i zdewastowano wnętrza. Po wyzwoleniu szkołę wyremontowano, a pierwsze zapisy miały miejsce 26 i 27 lutego 1945r. W roku szkolnym 1945/46 do szkoły uczęszczało 395 dzieci. Kierownikiem był p. Neubauer, który pracował na tym stanowisku do marca 1946r. Zaraz po wojnie, w 1945r. w szkole rozpoczęli pracę między innymi: p. Urszula Pietrzak (pracowała do 1975/76) i jej mąż śp. Aleksander Pietrzak – rodzice p. mgr Małgorzaty Kubiak (obecnej nauczycielki historii) oraz p. B. Mullerówna, mieszkająca do dzisiaj w Luboniu. Od 1.IX.1946r. kierownikiem szkoły był p. Fr. Sytniejewski, którego córki również mieszkają obecnie w Luboniu. W pierwszych latach po wojnie do 1948r. życie szkoły było mocno powiązane z kościołem. Później zaczęła się ateizacja.
W latach 50-tych duży nacisk położono na sport. Odbywało się wiele zawodów międzyszkolnych, prowadzonych w takich dyscyplinach jak lekkoatletyka, dwa ognie, w których nasza szkoła zdobywała pierwsze miejsca (np. w 1954r i 1956r.). W Luboniu odbywały się szkolne igrzyska letnie i zimowe (tor przeszkód, saneczkarstwo, łyżwiarstwo i inne dyscypliny).
Wielu obecnie uczących nauczycieli było uczniami naszej szkoły. Pierwszą uczennicą po wojnie od 1945r. była śp. Maria Gierdal. W latach 50-tych uczennicami naszej szkoły były: p. mgr Cecylia Jurewicz (wicedyrektor szkoły do 1998r.) i p. mgr Bożena Nowak (wicedyrektor do 2006r.). W latach 70-tych uczennicami naszej szkoły były: p. mgr Jolanta Skowrońska, mgr Jolanta Jakubowska, mgr Małgorzata Kubiak, mgr Hanna Hnat, mgr Małgorzata Pajkert. W latach 80-tych do naszej szkoły uczęszczały: mgr Elżbieta Szwedziak, mgr Beata Łakomy, mgr Małgorzata Celler.
Obecnym dyrektorem szkoły jest mgr Zbigniew Jankowski, który pełni tą funkcję od 1 września 1975r. W tym okresie odnowiono elewację zewnętrzną szkoły, drewniana klatka schodowa została zastąpiona żelbetonową, piece kaflowe zastąpiono gazowym ogrzewaniem, zlikwidowano ubikacje zewnętrzne. Boisko szkolne otrzymało asfalt. Została zbudowana sala gimnastyczna, w której gmachu mieści się również biblioteka szkolna i gabinet lekarski. Zagospodarowano również ogródek szkolny.



Od września 1999r. szkoła została przekształcona w ramach reformy w 6-letnią szkołę podstawową.
W opracowaniu historii szkoły pomogła pani mgr Cecylia Jurewicz – wicedyrektor szkoły do 1998 roku.
